从国内质谱仪的研究来看，企业产品化与国外存在一定差距，与此同时又面临新的压力——国外领军质谱仪公司在中国的本土化战略。这些仪器公司在推进本土化过程中和市场紧密联系，跟试剂、耗材等应用公司联合，共同发展。这样一来，给国内以仪器研发作为起步的公司很大挑战。
对于仪器研发来说，完全竞争态势下的科研是难以支持企业创新的。对国产仪器替代和研发创新，专家提出以下几个建议：
一、企业需要了解临床的使用需求，要做出非常符合临床需求的仪器。国外成熟的仪器企业来看，通用性仪器设备还是占据了主要地位，专用型仪器设备并非主导产品或方向。
二、提升仪器的稳定性，也是国产仪器的发展空间。
三、加大创新。仪器厂商和临床需紧密结合，从诊断方法学和仪器方法学多加探讨，投入大量精力做原始创新。创新来自于企业是不太可能的；来自临床是可能的，但是速度不见得快；创新来自临床与企业密切的结合才是最有效的道路！
学校、企业仪器研发人员需多多和临床紧密结合，真正抓住机遇，成为战略性合作伙伴，形成研发链条，这样才能推动国产医用仪器更好的发展。
